古代线的地核熔炉突然爆发出更强的能量，少女姜绾发现，熔炉的炉壁上浮现出禹启使者的虚影，他的手中拿着一枚金色的种子：“传承者，文明种子的核心是‘生命’，而非‘毁灭’。用绿星的生命能量，净化污染的根源！”虚影将种子递给少女，种子接触到熔炉的金色火焰后，瞬间生根发芽，长出的藤蔓顺着熔炉的管道，延伸到机关城的每一处角落，藤蔓上的花朵散发着能净化污染的香气。
现代线的矿脉深处，姜绾抓住沈彻破绽的瞬间，将青铜剑刺入陨铁原石的核心。剑身上的守陵人基因能量与启明号的能量融合，形成一道金色的能量波，将原石中的污染纹路彻底净化。沈彻的虚影发出凄厉的惨叫，逐渐消散在能量波中：“我不甘心……我本可以成为宇宙的主宰……”
当沈彻的意识彻底消失，现代线的净化阵恢复稳定，矿脉中的污染能量被完全清除。古代线的地核熔炉也停止了轰鸣，炉口开出一朵巨大的金色花朵，花朵的中心，结出了一枚泛着绿光的种子——这是绿星文明与地球文明融合后的“新文明种子”，承载着两个文明的生命力量。
危机解除后，启明号的文明种子库恢复正常。“编号98”重新整理数据库时，发现被污染的方案旁，自动生成了新的“文明共生方案”，方案中融合了夏朝的基因改造技术、绿星的生命科学和墨家的机关术，能在改造星球的同时，保护当地的原生文明。“这是禹启使者留下的‘自适应系统’，”“编号98”眼中满是敬佩，“他早就想到，文明的延续不是征服，而是共生。”
古代线的墨家机关城，少女姜绾将新文明种子种在苗圃中。种子很快发芽，长出的植物既有绿星文明的荧光叶片，又有地球植物的枝干形态，叶片上还浮现着墨家的螺旋符号。萧决看着这株“共生植物”，感慨道：“这就是文明种子的真正意义，将不同文明的优点融合，长出新的生命。”
为了践行“文明共生”的理念，盟约文明共同体决定实施“文明种子计划”，由地球文明主导，向宇宙中适宜居住的未开化星球，投放融合后的文明种子，帮助当地文明发展，同时传播“守护、共生”的盟约理念。启明号被任命为“种子投放舰”，姜绾与“编号98”担任舰长，负责执行这项跨越星际的使命。
出发前夜，现代线的昆仑墟中央广场举行了盛大的启航仪式。全球的人们通过直播见证这一时刻，广场上，启明号的全息投影与古代线墨家机关城的地核熔炉影像重叠，双时空的螺旋符号在空中交汇，形成一道巨大的能量光环。姜绾站在启航台上，手中举着那株共生植物：“三千年的传承告诉我们，文明的价值不在于征服多少星球，而在于守护多少生命，滋养多少新生。今天，我们带着文明的种子出发，去宇宙中播撒和平与希望。”
古代线的墨家机关城，少女姜绾与萧决站在启明号的复制品前，将刻有“共生”二字的青铜令牌，放入方舟的操控台。令牌与齿轮组合后，投射出玄星的详细坐标，以及夏朝人留下的“播种指南”：“播撒种子后，需留下守护者的基因印记，引导文明向正义方向发展，不可干预其自然演化。”
当双时空的启明号同时启航，现代线的方舟穿过文明守护墙，绿星文明的“水滴”飞行器作为护航舰队随行。航行途中，“编号98”发现了一颗被小行星撞击后的荒芜星球，星球上残留着微弱的生命信号。“这里适合投放第一颗文明种子，”她调出星球的环境数据，“我们可以用改造系统修复星球环境，让生命重新绽放。”
姜绾立刻下令启动星球改造系统。启明号释放出能量屏障，护住星球的核心区域；绿星舰队则投放出“大气生成装置”，将星球的二氧化碳转化为氧气；守护者团队则将文明种子与青铜结晶混合后，播种到星球的土壤中。种子接触到改造后的土壤，迅速生根发芽，长出的藤蔓覆盖了星球的荒芜地表，开出的花朵释放出大量的氧气，星球的环境开始快速改善。
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古代线的启明号也抵达了玄星。这里的环境与现代线发现的荒芜星球惊人地相似，少女姜绾将共生植物的种子播种到玄星的土壤中，萧决则在星球的核心区域，埋下了一枚刻有螺旋符号的青铜令牌——这是守护者的基因印记，将引导玄星文明的发展方向。当种子发芽的瞬间，玄星的天空中出现了一道彩虹，与现代线改造星球上的彩虹完全同步。
在投放完第一颗文明种子后，现代线的启明号收到了来自盟约文明共同体的通讯。通讯中，多个文明表示愿意加入“文明种子计划”，提供各自的核心技术，共同推动宇宙文明的共生发展。绿星使者的声音带着激动：“禹启使者的梦想正在实现，宇宙将不再有战争与掠夺，只有文明的共生与繁荣。”
航行途中，“编号98”的意识与启明号的数据库完全融合，她的记忆中，开始涌现出禹启使者当年播撒文明种子的场景：在遥远的星系，禹启使者将夏朝的种子播种到一颗星球上，留下守护者的印记后悄然离开，看着星球上的文明逐渐发展，露出欣慰的笑容。“我终于完全理解了我的使命，”“编号98”对姜绾说，“我们不仅是守护者，更是文明的‘播种者’。”
古代线的启明号返航时，少女姜绾在玄星上留下了一本用青铜片制成的《共生录》，记载着地球文明与绿星文明的共生理念，以及墨家的机关术、夏朝的基因知识。萧决则在星球的山脉上，刻下了巨大的螺旋符号，作为文明传承的标志。当他们的方舟离开时，玄星上的共生植物已经长成了参天大树，树上结出的果实中，蕴含着两个文明的基因能量。