加上洪承畴主持的绿营编制也进行了尾声，除了南京城留守的部分满蒙精锐大军外，勒克德浑得以调遣了大量的满、蒙、汉军、绿营和新附兵，准备对扬州城发动最为强大的攻势，希望毕其功于一役，具体参战的清军部队序列编制大致情况如下：

满洲部分有多罗承泽郡王硕塞、多罗贝勒爱新觉罗尼堪、固山贝子屯齐、和讬、贝子爱新觉罗尚善、辅国公爱新觉罗特尔祜、辅国公爱新觉罗杜尔祜、正白旗梅勒章京康喀赖、镶黄旗梅勒章京阿哈尼勘、署梅勒章京格霸库、正白旗护军统领他塔喇.阿济格尼堪、正白旗署护军统领爱新觉罗顾纳岱、伊尔都齐、费扬古、武拉禅等将所部一万人左右；

蒙古八旗部分有蒙古正红旗固山额真恩格图、蒙古镶红旗固山额真布彦岱、蒙古正白旗固山额真伊拜、蒙古正黄旗固山额真阿岱、蒙古镶蓝旗固山额真瑚什布、蒙古正黄旗梅勒章京韦征、蒙古正黄旗梅勒章京武京都、蒙古镶蓝旗甲喇章京尔堆、蒙古镶蓝旗牛录章京额尔特等部人马约一万人；

汉军八旗（不包括高度自理的孔有德和耿仲明两部）则有郎赛、邓长春、路有良、祖世祥、李向舜、祖应元等牛录章京以上的将领36员，所部甲士加上余丁和仆役，至少有一万人；

孔有德和耿仲明两部兵马合计六千余人；

绿营兵和新附未改绿营兵马则有徐恩盛部、吴守礼部、张应详部、薛守信部、石长庚部、王之纲部、高进忠部、李本深部、李遇春部、李朝云部、刘旺、韩应杰、艾怀英、孔希贵、夏尚忠、曹存性、李应宗、新投降的靖南军马岱所部等等，共有人马二十万人。

清军调集的进攻总兵力有二十三万六千人，以勒克德浑为总指挥，以洪承畴负责总后勤和战略安排，以悍将准塔为前线指挥官，多罗承泽郡王爱新觉罗硕塞率领各部主持东面进攻；

以多罗贝勒爱新觉罗.尼堪率领各部主持西面进攻；

以固山贝子爱新觉罗.屯齐率领各部主持北面进攻；

以辅国公爱新觉罗.杜尔祜（注：杜度长子）在江南对岸，组织高进忠所部、马岱两部水师，在长江之中，堵截明军前往南面的通道；

以镶黄旗梅勒章京阿哈尼勘率领本部并薛守信和石长庚两部，占据和州，封锁明军前往长江上游的江面；

以宗室贝子爱新觉罗尚善（注：舒尔哈齐的孙子）率领本部并刘旺、韩应杰部驻扎扬中，为堵截明军东下的第二道防线；

以辅国公爱新觉罗特尔祜（注：杜度的三儿子）率领本部并蒙旗人马数千人，为往来接应人马。

由此可见，清军主要作战方向的将领几乎全部为宗室成员，无论是将领配置还是兵力配置，均属于绝对顶尖的待遇了。