阎应元接着说文官是科举考试出来的，又是流官，文化上大部分是有真才实学的。武将却是世袭职务，时间久了很多都成了纨绔无能之辈。明初的屯田本来是国家财产，现在卫所兵和农民一样，屯田也被私人侵占，等于千万国家军饷被侵吞没了。主张废除武职世袭和卫所兵制，实行定期兵役制。这样才能让天下豪杰为兵将，退役后又加强地方武备，变死水为活水。不过这个方案要实施，就必须先进行一次彻底的人口普查。

崇祯听得非常高兴，连连点头表示赞同，说这样用武举代替科举选拔出来的人，再到军中历练三年才有为官的资格。这样地方官就是一方大将，可以主持当地军备，统计人口抽取壮丁练兵，朝廷再从中选出优异者调集到京师，就不愁边患和没有名将了。

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旁边高文彩提出地方官带兵可能会形成割据的顾虑，阎应元说他想过了，只要是流官，家属在异地，就不用担心出现割据。再说这制度是以县为基础，一县的人力物力即便知县有割据的野心也没有实力，和唐代节度史不一样。

也因为是流官经常变动，知府、巡抚、总督之间没有什么长期深厚的关系，即便督抚想割据下面的州府县也不会听他们的。而且只有其他地方弱，一个地方武力强才可能坐大成割据，只要各地军事实力都强，一个地方反叛割据也绝不是全天下的对手。“与其使天下皆弱，不如使天下皆强”，这句话让崇祯连连叫好，高文彩也觉得阎应元的分析无懈可击。

阎应元又提出想过在京城和地方分别设立武校，请熟读兵书和有实战经验的老兵当教师系统培育将帅，远胜现在将帅大多是自学成才。说最钦佩当年的戚继光，称他是文武双全，阵法器械都精通的奇才，当然是尊称“戚少保”。感叹当年如果有武校制度，戚帅的本领传授年轻学生，再培育出百多个年轻将帅代代相传，现在也不至于窘迫到缺将可用。

这时沈飞突然插嘴说：“我看到过论文，军校戚继光在蓟镇时办过，从军中选拔学生，三年一届，毕业后再派回到军中，只是制度没有传承下来。查查蓟镇史料应该能查到”，崇祯马上会意，对沈飞点了点头。其他几人虽然对沈飞直呼戚继光名字和“论文”、“军校”、“毕业”这些名字有些奇怪，不过大致意思也能明白，估计是崇祯请来的“世外高手”脾气有些古怪，也没说什么。

崇祯称赞阎应元大才，说恨不得马上让他当兵部尚书，至少也是提拔成锦衣卫指挥使。阎应元苦笑说那样他马上就会成为众矢之的，还不如当一个总旗自在。崇祯说任命阎应元为总旗，但是他不能真的只把自己当成一个区区总旗。总旗本来领兵五十人，特许他领一百人，这一百人让他自行招募豪杰，把这一百人都训练成阎应元那样的将才，每个人再各带百人，就相当于一支万人的精锐之师了。阎应元明白练出这支精锐，崇祯就有了实力镇住反对意见，提拔自己实施自己的计划了，语气激动恭敬地谢恩。

崇祯又让阎应元明天以总旗身份移驻昌平，以免在这里被本地人干扰，承诺明天就从内帑里拔出五万两白银，再裁减锦衣卫，省出十五万两来，也陆续拨给他。这二十万银怎么花完全由阎应元自己定，别人不干涉。要他在两个月里训练出百人精锐，两个月以后他要用。

沈飞又插嘴说：“二十万两不必省了，从我那里多拿几串珍珠出手很快就能凑齐”。