与此同时，随着李自成的大顺军从山西撤退，导致河南的形势也瞬间恶化，变得混乱起来。

河南总兵许定国纠集了一批散兵游勇，占据了睢州一带，原明朝兵部尚书张缙彦此时也逃回了河南，与召集当地官绅、土寇，与许定国勾结在一起，夺取大顺军在河南的地盘。

河南各地的土贼也乘势而起，如刘洪起占据汝宁，韩甲第占据许州，李际遇占据登封，刘铉占据襄城等，瞬间造成河南割据势力绵延数百里，拥众各十余万。

只是，土贼始终是土贼，哪怕其中兵力较强的刘洪起接受了弘光朝的招抚，在河南发动叛乱，大肆擒杀大顺朝的地方官员，可还是被大顺军棉侯袁宗第击败。

刘洪起只能率领残部逃入湖北，托庇于明总兵左良玉麾下，而其他河南的土贼，也因势力有限，以及其墙头草的个性，反复无常，终被大顺军消灭大半。

不过，随着大顺朝的李自成在陕西被满清击败的消息传到河南时，此前退走的刘洪起也卷土重来，领兵直至永宁、杞县一带，与开封府推官陈潜夫一道为明朝收复失地，并在柳园（开封城北）击败陈德率领的大顺军（陈德乃陈永福之子，原为明将，先是投靠大顺，后又降清。）

不久后，弘光朝就得到了消息，任命陈潜夫为巡按御史，刘洪起为总兵官，而后，又任命张缙彦为河南总督，越其杰为河南巡抚。（越其杰是马士英的姻亲）

可是，弘光朝由于定策引发的纷争，以及五镇自持拥立之功，全都丧失了上进之心，于是文恬武嬉，坐失良机，而距离河南最近且势力最强的明总兵左良玉，以及南京周边的江北五镇全都按兵不动，以至于在河南起义的明军在最需要增援的时候，没能得到任何弘光朝的帮助。

此时，南京方面，也就剩下淮阳督师史可法还在口都上谈论北上，恢复、鲁、豫，乃至燕京的事，只是，目前的南京，形格势禁，史可法也一筹莫展。

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1646年，五月初。

李自成率领大顺军撤退到湖北襄阳一带，此时，李自成麾下有从西安、河南带来的十三万大军，又把原来部署在襄阳、承天、德安、荆州四府的七万兵力调来，其麾下的总兵力也达到了二十万。

同时，李自成也与满清的计划一样，打算水陆并进，夺取南京城。

以南京城为据点，再次与满清争夺天下。